МБИ-1 является средней по сложности моделью биологического микроскопа. Он используется для исследований прозрачных слайдов в проходящем свете. При использовании специальных конденсоров или других принадлежностей можно вести наблюдение в темном поле или в отраженном свете. Микроскоп МБИ-1 может быть использован для работы в ботанике, сельском хозяйстве, в заводских производственных лабораториях и т.д.. Микроскоп имеет наклонный тубус для наблюдения и сменный прямой тубус для микрофотографии. Крепление и смена объективов осуществляются с помощью револьверной насадки с четырьмя гнездами. Предметный столик круглый, вращающийся. На поверхности столика имеются отверстия для крепления приставного препаратоводителя. Осветительный аппарат состоит из двухлинзового конденсора, ирисовой диафрагмы с кольцевидным держателем и двустороннего зеркала. Апертура конденсора при использовании масляной иммерсии равна 1,2, без иммерсии — 1,0. Верхняя линза конденсора может быть свинчена, при этом апертура снижается до 0,5. Микрометрический винт снабжен барабаном с делениями. При повороте барабана на одно деление тубус микроскопа передвигается на 0,002 мм.